Depende da aceleração que esse software suportar. Se fizer uso do CUDA, o mais importante é a parte gráfica (Nvidia), visto o processamento com CUDA ser muito mais rápido do que com CPUs. Por outro lado, se suportarem o QuickSync da Intel, um bom CPU Quad-Core faz milagres e regra geral nem gráficas topo de gama lhe chegam aos pés.
Se não suportar nenhuma das duas tecnologias (o que seria muito estranho nos dias de hoje), aposta mais no CPU. Tenta saber isso e depois escolhes, se suportarem CUDA, aposta na gráfica e se suportarem o QuickSync, dá mais importância ao CPU. Se acontecer de suportar os dois, dá primazia ao CPU, visto o mesmo trabalho ser feito mais rápido com QuickSync do que com CUDA, na grande maioria dos casos.
Ou seja, em termos de prioridade, basicamente só se vale a pena apostar forte na gráfica se for para usar CUDA, de resto, o CPU torna-se mais importante.
CUDA - Placa Gráfica (Nvidia)
QuickSync - CPU
CUDA + QuickSync - CPU
Nenhuma das tecnologias - CPU